Verpakkingspapier is een poreus materiaal; de fundamentele structuur bestaat uit plantenvezels en hulpadditieven, waardoor het sterke hydrofiele eigenschappen heeft. Bij blootstelling aan vocht ondergaat papier vervorming; in ernstige gevallen kunnen er schimmelvlekken ontstaan en tijdens opslag is het gevoelig voor verkleuring en een vermindering van de treksterkte.
Opslagmagazijnen moeten droog worden gehouden en de luchtvochtigheid in de omgeving moet strikt worden gecontroleerd. Bij het stapelen van papier moet het worden opgetild met behulp van houten dwarsliggers-die ongeveer 25 mm boven de vloer worden geplaatst-en op een afstand van de muren worden gehouden. Er moeten aanzienlijke openingen tussen de pallets worden aangehouden om voldoende ventilatie mogelijk te maken. Eenmaal gestapeld moeten het papier en de pallets veilig in elkaar worden gewikkeld met behulp van rekfolie. De voorraad moet periodiek worden geïnspecteerd-met bijzondere aandacht voor de staat van de bodem-de meeste pallets-en het 'First-In, First-Out'-principe (FIFO) moet strikt worden nageleefd om achteruitgang van het papier als gevolg van langdurige opslag te voorkomen. Tijdens gebruik-met name na het snijden of tijdens het drukproces-moeten alle overgebleven papiersnippers of ongebruikt materiaal onmiddellijk in rekfolie worden gewikkeld om ze tegen vocht te beschermen.
Bij het vervoeren van breekbare artikelen kan verfrommeld verpakkingspapier worden gebruikt als opvulmateriaal- om lege ruimtes in de verzendcontainer op te vullen, waardoor verschuiven van artikelen en krassen op het oppervlak worden voorkomen [16]. Kartonnen dozen gemaakt van verpakkingspapier vereisen ook bescherming tegen vocht; bovendien moeten, gezien hun lage ontstekingspunt, tijdens de opslag speciale brandveiligheidsmaatregelen in acht worden genomen. Kartonnen dozen die bedoeld zijn voor het verpakken van voedsel mogen niet worden hergebruikt, omdat dit de verspreiding van bacteriën in gevaar brengt en de voedselveiligheid in gevaar brengt.